Fenrikskolen fik til huse i træbarakker på Flyvestation Værløse, Nord.
Den første fenrikklasse blev oprettet den 1. September 1951.
Officersskolen rykkede ind i lejede lokaler på Rungsted Strandvej 62.
Den første officersklasse, klasse 1951/52,begyndte officersuddannelsen den 15.
november 1951. Før den egentlige
officersuddannelse gennemgik eleverne
"Flyvevåbnets Officersskoles
Forberedelseskursus".
Kurset havde en varighed på ca. 40
arbejdsuger med undervisning 4 dage om
ugen fra kl. 1500 til kl. 1745, og
kursisterne blev undervist i matematik,
fysik, historie, engelsk og dansk.
Da eleverne sideløbene med kurset, som
det hed: "I videst muligt omfang skal
varetage deres pligter og uddannelse ved eskadriller og station", blev kurset gennemført på forskellige flyvestationer eller på gymnasier i nærheden af flyvestationerne.
Da Jonstrup Statsseminarium i 1955 flyttede fra Jonstrup til Lundtofte, overtog Flyvevåbnet bygningerne i Jonstrup. Der var hermed skabt mulighed for at samle officersskolen og fenrikskolen i mere tidssvarende lokaler. Den første officersklasse, der begyndte i skolens bygninger i Jonstrup var klasse 1955/56.
Eftersom klassen blev oprettet den 2. Maj 1955 og seminariets elever først afsluttede deres eksamen i juni 1955, var der i dette tidsrum både elever fra statsseminariet og officersskolen.
Året efter flyttede Flyvevåbnets Fenrikskole også til Jonstrup, og de to skoler var herefter samlet i de samme bygninger. På trods af, at Flyvevåbnets Officersskole og Flyvevåbnets Fenrikskole havde til huse i de samme bygninger og havde samme chef, forblev de selvstændige skoler indtil 1. Januar 1970.
Fenrikskolen ændrer dog navn i 1960 til Flyvevåbnets Specialofficersskole, og med klasse 1962/65 optog man også ikke-piloter på Flyvevåbnets Officersskole.
Ved sammenlægningen af de to skoler blev uddannelse opdelt i en A- og en B-linie, og skolen fik det navn den har i dag, Flyvevåbnets Officersskole.
Som et naturligt led i udviklingen har også kvinderne holdt deres indtog på skolen, og den første kvindelige kadet afsluttede officersuddannelsen i 1977.
I stedet indledte man en grunduddannelse for officerer, efter hvilken man bliver udnævnt premierløjtnant og en videregående officersuddannelse som overbygning på den første, hvor man efterfølgende bliver udnævnt til kaptajn.
Skolen har siden 1995 ligget i Jonstruplejren i moderne og tidssvarende bygninger i et naturskønt område.
De ca. 150 elever og kadetter der går på skolen bliver undervist i et omfattende pensum af både militære og civile fag på et højere akademisk niveau.